隨著化肥工業的快速發展，化肥使用量不斷增長，有機資源利用率低，針對這種情況，農業部公布了《對十二屆全國人大四次會議第3698號建議的答復》，將會采取一系列措施，鼓勵和引導農民科學使用化肥、增施有機肥料。
      2008年起，中央財政安排耕地質量保護與提升專項經費，通過技術補貼，鼓勵和引導農民實施農作物秸稈還田，恢復種植綠肥和增施有機肥。北京、江蘇、上海、浙江等省市相繼出臺了農民施用商品有機肥補貼的政策，補貼金額每噸150-450元不等。2014年國家農業綜合開發辦公室下發了《國家農業綜合開發辦公室關于支持有機肥生產試點的指導意見》（國農辦〔2014〕156號），中央財政安排資金試點省份建設了一批以農作物秸稈為主要原料的有機肥廠，適當扶持養殖業畜禽糞便資源循環利用，支持一批高效肥料的生產。
      農業部表示，下一步將會同財政部等部門，從三個方面加大工作力度，推動有機肥的推廣應用：
      一是積極爭取政策扶持。不斷完善財政、稅收、金融等政策，支持有機肥推廣應用。深入開展畜禽糞污等廢棄物綜合利用試點，研究設立財政補貼專項，鼓勵和引導農民使用有機肥。
      二是集成配套技術模式。結合測土配方施肥、耕地保護和質量提升等項目的實施，進一步完善區域性肥料配方和施肥指導意見，做好宣傳培訓工作，提升農民使用有機肥，提升耕地地力的意識。針對不同區域耕地地力情況，通過示范引領，集成推廣測土配方施肥和增施有機肥技術，減少化肥的不合理使用，培育良好的土壤生態環境。

      三是推動耕地質量保護立法。積極推動耕地質量保護、肥料管理等法律法規的制定工作。通過立法，鼓勵肥料使用者采用環境友好型、資源節約型技術，按照“用地養地相結合”的要求增施有機肥、提高耕地質量。